Гербы, как отличительные знаки рода, территории или целого государства, существуют с давних пор.
Первая эмблема Сибири в виде стрелы известна с 1555 года, когда сибирский хан Едигер обязался быть данником русского царя Ивана 4.
В начале 17 века сибирская эмблема выглядела уже по-другому : два соболя, стоявших по бокам дерева на задних лапах. Известно еще одно, уже третье по счету , изображение сибирской эмблемы. На тарелке царя Алексея Михайловича вычеканены два соболя, стоящие на задних лапах и держащие стрелу острием вниз. Тарелка эта датируется 1675 годом.

В мае 1729 года появился первый Томский герб : " Человек, стоявший в рудокопне, в руках рудокопательные инструменты, поле желтое". Дело в том, что в конце 17 века в Сибири начались усиленные поиски цветных и черных металлов.

В 1782 году в Сибири было учреждено обширное Тобольское наместничество. Томск входил в него на правах областного города и в 1785 году получил соответствующий герб : " В верхней части герб Тобольский, в нижней, в зеленом поле, серебряная лошадь". Богатых залежей рудных ископаемых в окрестностях Томска не нашли, и Томск не стал промышленным центром. Зато он получил широкую известность как торговый центр, крупный пункт перевалки грузов. В 18 веке через Томск пролег Московский тракт. Извоз и разведение лошадей становились выгодным делом. Отсюда и лошадь на гербе.
В 1851 году Николай Первый дал указание : " Принять на будущее время за правило на гербах губерний, областей, и губернских городов, кои впредь будут представляемы на высочайшее утверждение, изображать всегда императорскую корону".
Волю монарха выполнил барон В.В.Кене. Заняв в 1857 году пост ученого - геральдика, он унифицировал существовавшие гербы. Гербы старинных русских городов получили царскую шапку, наподобие мономаховой. Кроме того, гербовые щиты губернских центров стали обрамляться дубовыми листьями с андреевской лентой.
Губернский Томск получил свой герб со всеми положенными ему по статусу украшениями 5 июля 1878 года и пользовался им вплоть до 1917 года.

С 29.05.97 принят закон Томской области " О гербе и флаге", который установил прежние символы области, их описание и порядок использования.